依托清华附中雄厚的师资力量，昆明西南联大研究院附属学校面向全国广聘名师，凝聚了各学科众多骨干教师，形成了结构合理、整体效能最大化的师资团队。教师队伍中硕士及以上学历者近30％，大部分教师毕业于清华大学、中国科学院、北京师范大学、东北师范大学、南开大学、南京大学、西北大学、澳门大学等重点院校。学校现有省、市、区级骨干教师、学科带头人16名，占比约10％，正高级教师2名、特级教师4名、引进高级人才25人，骨干教师35人，学科带头人2人，骨干教师及学科带头人占比14.1%。同时，清华附中选派在职在编的骨干教师长期驻校，开展听课、评课、举办讲座等。学校注重教师团队建设，搭建教师专业发展平台，成立中文、数学、外语、人文、艺体、科技六大研究院，研究院的老师涉及小、初、高三个学段，不仅有利于小学到初中、初中到高中的衔接培养，更为以科研引领教学奠定了扎实的基础。